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《澳藏》《大藏经》《药师琉璃光如来本愿功德经·马琴阖家供奉》
《澳藏》版《大藏经》-《药师琉璃光如来本愿功经》校订本
初译稿底本来源：世佛研编委会
校订人：杨亚军 曹伊洁
校订日期：二零二六年九月十四日
《澳藏·药师琉璃光如来本愿功德经》
第二千零六十六函卷
四者广修供养，从日常生活中以华鬘供佛、以涂香供佛、以鼓乐供佛、以众伎供佛、以一切清净美好供养三宝、供养法界、供养一切众生，以财供养、以法供养、以无畏供养、以一切供养圆满功德、圆满资粮、圆满佛道，此是供养波罗蜜之实践、是功德之源泉、是圆满之基础；(。)
五者营造人间净土，从日常生活中以第十二大愿之精神营造人间净土、建设美好家园、创造和谐社会、实现现世安乐，从自身做起、从家庭做起、从社区做起、从社会做起，令一切众生皆得衣服圆满、皆得资生圆满、皆得环境庄严、皆得生活美好、皆得人间净土，此是药师法门人间佛教之精神、是第十二大愿之落实、是现世安乐之体现；(。)
六者随心满愿，从日常生活中以专念受持求一切正当所愿、求一切清净所求、求一切有益所愿，求衣服得衣服、求宝具得宝具、求供养得供养、求娱乐得娱乐、求圆满得圆满、求成佛得成佛，一切正当清净有益之所愿，皆得满足、皆得圆满、皆得遂心，此是专念受持之真实利益、是佛力加持之真实体现、是第十二大愿之真实感应；(。)
七者惭愧忍辱，从日常生活中以惭愧为衣、以忍辱为服、以柔和为装，时时惭愧、处处忍辱、念念柔和，以惭愧遮烦恼之身、以忍辱御嗔恨之寒、以柔和庄严菩提之心，令身心清净、令功德圆满、令法身庄严，此是衣服之深义、是修行之要诀、是佛道之基础；(。)
八者发菩提心，发大菩提心、上求佛道、下化众生、修行六度万行、实践菩萨道、自利利他、圆满佛果，此是修行之归趣、是佛道之根本、是成佛之因、是一切圆满之究竟。
具此八门可落实方法，当代僧俗皆可修行、皆可专念受持、皆可蒙佛神力、皆得上妙衣服、皆得一切宝庄严具、皆得华鬘涂香鼓乐众伎、皆得随心所玩皆令满足、皆得圆满佛道。
一切修学者但能依此八门、精进修行、不退转，皆得蒙药师如来加被、皆得善根成熟、皆得第十二大愿圆满、皆得现世安乐、皆得命终往生、皆得圆满佛道。
第十二大愿之不可思议功德、衣服之六层深广义、蚊虻寒热之五层比喻、宝庄严具之五层深广义、华鬘涂香鼓乐众伎之四层供养、专念受持之六层方法、随心所玩皆令满足之五层圆满、祖师开示之种种、现实应用之八门方法，广说无尽、说不能尽，如来于一劫若一劫余说不能尽，况凡夫二乘、况末代凡夫、况薄地凡夫。
然其核心纲要、其根本精神、其修行要领、其究竟归趣，即是以第十二大愿为圆满总结、以闻名号为得度之因、以专念受持为修行之要、以佛神力为加持之本、以上妙衣服为离苦之始、以一切宝庄严具为资生之圆、以华鬘涂香鼓乐众伎为供养之满、以随心所玩皆令满足为究竟之归、以圆满佛道为终极之趣。
一切众生但能闻名持名、专念受持、信受奉行、精进修行，皆得蒙佛神力、皆得上妙衣服、皆得一切宝庄严具、皆得华鬘涂香鼓乐众伎、皆得随心所玩皆令满足、皆得现世安乐、皆得命终往生、皆得圆满佛道。
此段经文从第十二大愿起，至随心所玩皆令满足止，层层开显药师如来第十二大愿之不可思议功德、步步昭示本愿威力之广大慈悲、处处启发专念受持之真实利益、时时鼓励一切贫苦众生之修行精进，令一切众生知佛愿之广大、知名号之功德、知专念之要诀、知满愿之可期，实为十二大愿之圆满总结、是人间净土之终极体现、是现世安乐之圆满归趣、是一切众生所求满足之保证。
一切修学者应当深心信受、反复研读、持名持经、专念受持、布施衣服、广修供养、营造人间净土、随心满愿、惭愧忍辱、发菩提心、广为人说、令法久住，令药师法门之精神广布人间、令第十二大愿之利益普利群生、令随心满足之功德遍于十方、令一切众生皆得离苦得乐、皆得资生圆满、皆得随心所玩皆令满足、皆得往生净土、皆得圆满佛道。
十二大愿最后圆，贫无衣服佛哀怜。蚊虻寒热昼夜逼，闻名专念即离苦。
上妙衣服随心好，七宝庄严一切具。华鬘涂香鼓乐伎，随心所玩皆满足。
衣服六层遮身暖，惭愧忍辱法身圆。蚊虻五层烦恼业，生死无明一时捐。
宝具五层功德聚，法身净土一心全。供养四种华香乐，法供养圆福慧坚。
专念六层一心乱，净念相继信不偏。日常相续本愿应，决定满愿到佛天。
人间净土终极显，现世安乐圆满归。三根普被无机遗，毕竟圆满大菩提。
当代僧俗当精进，持名持经专受持。八门方法皆落实，决定圆满一切愿。
曼殊室利，是为彼世尊药师琉璃光如来、应、正等觉，行菩萨道时，所发十二微妙上愿。复次，曼殊室利，彼世尊药师琉璃光如来行菩萨道时，所发大愿，及彼佛土功德庄严，我若一劫、若一劫余，说不能尽。然彼佛土一向清净，无有女人，亦无恶趣及苦音声，琉璃为地，金绳界道，城阙、宫阁、轩窗、罗网皆七宝成。
此段经文，乃《药师琉璃光如来本愿功德经》中承前启后之枢纽，前则总标药师如来因地所发十二根本大愿，后则广陈东方净琉璃世界依正二报之功德庄严，文虽简略，义则深广，实为全经之纲领、修行之指南。曼殊室利四字，乃世尊呼当机大士之名，亦是对一切修学者之告诫。
曼殊室利，梵语 Mañjuśrī，译曰妙吉祥，又译妙德，以其智慧第一、慈悲平等，为七佛之师、菩萨之母，故世尊每以之为当机而宣说深法。
此处世尊复呼曼殊室利，意谓此十二大愿与净土庄严，非是浅小智识所能测度，唯有以文殊般若之妙慧，方能照见其深义、信受其功德、践行其愿海。是为二字，乃是确定之辞、印定之语，谓前文所宣说者，即是彼东方药师琉璃光如来之行愿，非是余佛、非是余菩萨，乃是专指药师如来，令一切众生决定信受、不生疑惑。
彼世尊三字，含摄无量敬义，彼者对此之辞，指东方去此过十恒河沙等佛土之世界；世尊者，佛之通号，谓世出世间最尊最胜，为天中之天、圣中之圣，一切众生所应恭敬供养。
药师琉璃光如来，乃此佛之德号，前已广释，今略明其要：药师者，喻能疗治众生身心二病之大医王，世间医师但能治身病，不能治心病，但能治现世之病，不能治多生之业病，药师如来则能普治一切众生种种病苦，以法药为药、以愿力为医、以慈悲为方，令一切众生离苦得乐；(。)
琉璃光者，喻佛身清净无瑕、光明遍照，如琉璃宝，内外明彻，无有秽恶，能映现一切诸法实相，能破除一切众生无明黑暗；如来者，佛之十号之一，谓乘如实之道而来成正觉，亦如过去诸佛之来而来，无所从来亦无所去，故名如来。应、正等觉，乃是佛之别号，具足应供、正等觉二义，此处经文略去供字，但言应，实即应供。
应供者，梵语 Arhat，译曰应供，谓佛已断尽一切烦恼、具足一切功德，应受人天供养，为世间最大福田，一切众生供养于佛，能得无量福德。
正等觉者，梵语 Samyaksaṃbuddha，译曰正等觉，谓佛于一切法正觉无误、平等普照，无有余习、无有不知，不同二乘之偏真、不同菩萨之分证，乃是究竟圆满之无上正等正觉。此二号合言，显药师如来已断证圆满、福慧具足，既应受供，又正遍知，故其愿力真实不虚、其净土功德不可思议。
行菩萨道时一句，乃是标明愿力发起之时节，谓药师如来在因地修行菩萨道之时，非是成佛之后方发此愿，乃是于因地中早已发此大愿，历劫修行，愿愿相续，直至成佛，愿乃圆满。
菩萨道者，即是上求佛道、下化众生之道，以六度万行为体、以四无量心为用、以菩提心为本，菩萨于生死海中，不辞劳苦，不畏轮回，为度一切众生故，难行能行、难忍能忍，积集无量福慧资粮，终成佛道。
药师如来于行菩萨道时，即发此十二微妙上愿，可见其愿心之深切、其悲心之广大，非是成佛之后方始度生，乃是于因地中早已以众生为念、以佛道为归。
所发十二微妙上愿，乃是总标药师如来因地所发之十二根本大愿。十二者，表圆满之数，以十二门统摄一切度生之法，愿愿皆含无量义趣、愿愿皆度一切众生；微妙者，谓此十二愿非是凡夫二乘之所能思议，乃是菩萨甚深般若之所流现，体即法界、用即无方，不可思议、不可称量；(。)
上愿者，谓此十二愿最为殊胜、最为第一，超胜一切余愿，能令一切众生现世安乐、毕竟解脱，故名上愿。此十二大愿，前文已一一广释，今则总而标之，令一切众生知药师如来之功德，皆由因地愿行而来，非是自然而有、非是无因而得，乃是历劫修行、愿愿相续之所成就。
复次二字，乃是承前启后之辞，谓前文已明十二大愿之总标，今复更进，广说彼佛土之功德庄严，令一切众生非但知药师如来之愿行，亦知其净土之殊胜，发愿往生，亲近供养。
彼世尊药师琉璃光如来行菩萨道时，所发大愿，及彼佛土功德庄严，我若一劫、若一劫余，说不能尽。此四句，乃是世尊自谦之辞，亦是显功德无量之语。谓药师如来因地所发之大愿，非但有十二，其实愿愿之中又含无量细愿，一一愿皆无量无边；彼佛土之功德庄严，亦非但有前文所说之少分，实则依正二报、主伴圆融，无量无边。
世尊虽具一切智、虽有无量辩才，若以一劫之长时间、或一劫有余之长时间，广说药师如来之愿行与净土功德，亦不能说尽，何况凡夫二乘、何况末代众生，岂能以分别心而测度其边际。
然此非是世尊智辩不足，乃是药师如来之功德真实无量，唯佛与佛乃能究尽，等觉菩萨尚不能尽知其边际，何况凡夫。我若一劫若一劫余说不能尽一句，正显药师法门之广大、净土功德之无量，令一切众生生难遭想、生稀有想，精进修学，不生懈怠。然彼佛土一向清净，无有女人，亦无恶趣及苦音声。
此下正明东方净琉璃世界之功德庄严，先明正报清净，次明依报庄严。然彼佛土者，指东方净琉璃世界，乃药师如来所化之净土；一向清净者，谓彼佛土从来清净、毕竟清净，非是先秽后净、非是暂净还秽，乃是本来清净、究竟清净，无有杂染、无有过患。
清净有二义：一者体清净，谓彼佛土以法性为体，离一切妄执、离一切烦恼，本来空寂、本来光明；二者相清净，谓彼佛土依正二报，皆以七宝所成，无有瓦砾、无有荆棘、无有粪秽、无有一切不净之物，眼所见者皆清净色、耳所闻者皆清净音、鼻所嗅者皆清净香、舌所尝者皆清净味、身所触者皆清净触、意所缘者皆清净法，六根对六尘，皆是清净，无有染著。
无有女人者，谓彼佛土纯是男子、纯是菩萨，无有女人之身，亦无有女人之名。此非是轻视女人，乃是表法之义：女人表烦恼、表爱欲、表生死，以女人多烦恼、多爱执、多障道，故净土中无有女人，表一切烦恼皆已断尽、一切爱执皆已舍离、一切生死皆已解脱。
又女人表阴界入之幻妄，无有女人，表五阴十八界十二入皆空，无有实法可得。又经中说，药师如来第八大愿，愿一切女人闻佛名者，皆得转女成男，故彼佛土无有女人，正是第八大愿之成就、药师愿力之真实。
亦无恶趣者，谓彼佛土无有地狱、饿鬼、畜生三恶道，亦无有阿修罗之斗诤，纯是善道、纯是菩萨，无有造恶之众生、无有受苦之有情。恶趣者，乃众生造作恶业之所感得，彼佛土中众生皆行菩萨道、皆修十善业、皆发菩提心，故无有恶业、无有恶报，自然无有恶趣。
及苦音声者，谓彼佛土中无有种种苦恼之音声，无有啼哭之声、无有呻吟之声、无有怨叹之声、无有斗诤之声、无有毁骂之声，一切音声皆是念佛、念法、念僧之声，皆是说法、赞叹、欢喜之声，令人闻者自然清净、自然发心。
苦音声者，乃众生苦恼之表现，彼佛土中众生无有众苦、但受诸乐，故无有苦音之声。琉璃为地，金绳界道，城阙、宫阁、轩窗、罗网皆七宝成。此下广明依报庄严，以琉璃为地、以金绳为道、以七宝为城阙宫阁，种种庄严，不可穷尽。琉璃为地者，谓彼佛土之地，皆以琉璃宝所成，非是土石瓦砾。
琉璃者，梵语 Vaidūrya，译曰青色宝，其性莹澈、内外明净，能映现一切景物，如镜照像，无有隐覆。以琉璃为地，表药师如来清净法身遍一切处，内外明彻、无有障碍，一切众生于中各见自身、各见诸法，如镜中像，虽显现而无有实性。
又琉璃为地，表心地清净，修行者若能自净其心，则所处之土自然清净，所谓心净则国土净，正是此义。
金绳界道者，谓彼佛土道路之间，以黄金为绳，界分道路，令其平直，无有崎岖、无有泥泞。金者坚固不坏、光明无染，表菩提心坚固、金刚不坏；绳者表轨则、表道路，以金绳界道，表修行之路有轨则、有次第，不偏不倚、不迂不邪，直趋佛道。
又金绳界道，表药师如来以本愿力为一切众生划定修行之路，令其不迷不惑、不入邪途，决定得至涅槃彼岸。
城阙者，城谓城池、阙谓宫门外之观楼，皆所以为防卫、为庄严。彼佛土之城阙，皆以七宝所成，高广巍巍，光明照耀，非是人世土木之所能比。宫阁者，宫谓殿宇、阁谓楼阁，乃诸佛菩萨所居之处，皆以七宝所成，层层叠叠，无有穷尽，每一宫阁之中皆有无量宝座、无量宝具，种种庄严。
轩窗者，轩谓窗槛、窗谓户牖，皆以七宝所成，玲珑剔透，光明交映，无有障碍。罗网者，谓以七宝丝线编织成网，悬于宫殿之上，网上皆有宝铃、宝珠，微风吹动，出微妙音，说种种法，令人闻者自然清净。
皆七宝成者，谓上来所说城阙、宫阁、轩窗、罗网，皆以金、银、琉璃、玻璃、砗磲、赤珠、玛瑙七种宝物所成，光明遍照，无有暗冥。七宝表七觉支、表七圣财、表七日之光明，一一宝中皆含无量义趣、无量功德。
此段经文，文约义丰，看似只是叙述净土庄严，实则含摄修行之全部要义，若仅作净土境界观之，则失其大半，当一一会归自心，方知佛说净土，即是说自心之庄严、即是说修行之果报。
愿海汪洋不可穷，琉璃国土现其中，若能会得唯心义，何须远问主人翁。
经文虽简，义理则深，若欲深入此段之奥妙，当从名相、义理、观行、证入四个层面，层层剖析，方知世尊说此经文，非是徒陈净土之胜妙，乃是为一切众生指示修行之轨则、成佛之阶梯。先就名相而论，此段经文中诸多名相，一一皆含无量深义，不可草草读过。曼殊室利，前已略释，今更广明。
曼殊者，妙也；室利者，德也、吉祥也。曼殊室利，即是妙德、妙吉祥。何以名为妙德？以其智慧不可思议，能于一切法通达无碍，不同二乘之偏智、不同凡夫之世智，乃是究竟圆满之妙智，故名妙德。
何以名为妙吉祥？以其能令一切众生离苦得乐、逢凶化吉，所谓文殊菩萨到处，吉祥安乐，故名妙吉祥。此菩萨于过去无量劫前早已成佛，号龙种上如来，为度众生故，现菩萨身，辅助释迦牟尼佛弘化娑婆，为诸菩萨之上首、智慧之代表。
世尊每说深经，必以曼殊室利为当机，以非大智慧不能信受深法、非大智慧不能为众生请问故。此处世尊呼曼殊室利而说药师愿行与净土功德，意谓此法甚深，唯有以文殊之妙慧，方能信解受持，末世众生若欲修学药师法门，当以般若智慧为眼目，方能不迷不惑、不入歧途。
是为二字，看似平常，实则含摄决定信受之义。是者，此也、确定也；为者，是也、当体也。是为，即是此正是、此决定是，无有疑惑、无有犹豫。世尊说此二字，乃是为一切众生作决定证明，谓前文所说之十二大愿，决定是药师如来因地所发，非是余佛、非是菩萨，令一切众生闻已，决定信受，不生疑虑。
末世众生修行，最大之障碍即是疑心，疑则不信、不信则不行、不行则不得益，故世尊特以是为二字，印定其说，令众生断疑生信。彼世尊三字，彼者对此之辞，指东方净土，去此娑婆世界过十恒河沙等佛土；世尊者，如前释，为世出世间最尊最胜。
彼世尊合言，谓彼东方世界之世尊，即是药师琉璃光如来，与此娑婆世界之世尊释迦牟尼佛，佛佛道同、愿愿相通，只是所化之世界不同、所摄之根机有异。药师琉璃光如来，此六字名号，含摄无量功德，若人至心称念，则能消灾免难、增福延寿，现世安乐、命终净土。
今就名相而论，药师者，世间之医师，有四种：一者医师，能诊病开方；二者药师，能配药治病；三者护士，能看护病人；四者养生，能调养身体。药师如来则四者具足，能诊众生无明之病、能开法药之方、能配戒定慧之药、能看护修行者、能调养法身慧命，故称药师。琉璃者，七宝之一，其性莹澈，内外明净，无有瑕秽。
药师如来身如琉璃，内外明彻，净无瑕秽，光明遍照，无有障碍，故以琉璃为喻。光者，光明也，有二种：一者身光，佛身放光明，遍照十方；二者智光，佛智光明，破除众生无明黑暗。药师如来之光明，身智不二，身即是智、智即是身，故称琉璃光。
如来者，如谓如实，来谓来世，乘如实之道而来成正觉，故名如来。又如者不异，来者不去，以不异不去之体，现来世之相，故名如来。应、正等觉，乃佛十号之二。应者应供，谓佛已断尽一切烦恼、具足一切功德，应受人天供养，为世间第一福田。
正等觉者，正谓不偏、等谓平等、觉谓觉悟，佛于一切法正觉无误、平等普照，无有不知、无有不证，故名正等觉。此二号，显药师如来断证圆满，既应受供，又正遍知，故其愿力真实、其净土安稳。
行菩萨道时，此六字最为要紧，显药师如来之愿力，非是成佛之后方始发起，乃是于因地修行菩萨道时，早已发此大愿。菩萨道者，菩提萨埵之道，菩提谓觉，萨埵谓有情，菩萨即是觉有情，既能自觉，又能觉他。
菩萨道有六度：布施、持戒、忍辱、精进、禅定、般若，以六度为体，以四摄为用，以四无量心为根，历劫修行，不辞劳苦，为度一切众生故，难行能行、难忍能忍。药师如来于行菩萨道时，即发十二大愿，可见其愿心之深切、悲心之广大，非是少善根少福德之所能发起。
所发十二微妙上愿，十二者表圆满，以十二门统摄一切度生之法；微妙者不可思议，上愿者最胜第一。此十二大愿，愿愿皆是为众生离苦得乐而发，愿愿皆是为众生成佛道而设，无一愿是为自身、无一愿不度众生，故名微妙上愿。复次二字，复谓重复、次谓次第，复次即是更进一层、更说一段。
前文已明十二大愿之总标，今复更进，广说净土功德，令一切众生非但知药师如来之愿行，亦知其净土之殊胜，发愿往生，亲近供养。我若一劫若一劫余说不能尽，一劫者，世界成坏一次之时间，其长无量，佛经中说，以人寿十万岁时，每百年减一岁，减至十岁，再每百年增一岁，增至十万岁，此一增一减，名为一小劫；二十小劫为一中劫；四中劫为一大劫。
一劫之长，已不可思议，何况一劫有余，更复长远。世尊虽有无量辩才、虽具一切种智，若以一劫或一劫余之长时间，广说药师如来之大愿与净土功德，亦不能说尽，可见药师如来之功德真实无量，唯佛与佛乃能究尽。
然彼佛土一向清净，然者转折之辞，谓虽复功德说不能尽，今且略说其少分，令一切众生得知大概。彼佛土者，东方净琉璃世界；一向清净者，从来清净、毕竟清净，非是先秽后净、非是暂净还秽。
清净有三义：一者戒清净，彼土众生皆持净戒，无有毁犯；二者心清净，彼土众生皆离烦恼，无有染著；三者国土清净，彼土依报皆以七宝所成，无有秽恶。三义圆融，不可分割，戒净则心净，心净则土净，故云一向清净。
无有女人，前已略释，今更广明。女人者，表烦恼、表爱欲、表生死，以女人多烦恼、多爱执、多障道故。净土中无有女人，表一切烦恼皆已断尽、一切爱执皆已舍离、一切生死皆已解脱。
又女人表阴界入，无有女人，表五阴十八界十二入皆空，无有实法。又药师如来第八大愿，愿一切女人闻佛名者转女成男，故彼土无有女人，正是愿力成就。亦无恶趣，恶趣者，地狱、饿鬼、畜生三恶道，乃众生造恶之所感得。
彼土众生皆行十善、皆发菩提心，故无有恶业、无有恶报。及苦音声，苦音声者，众生受苦所发之音声，啼哭、呻吟、怨叹、斗诤，皆是苦音。彼土众生无有众苦、但受诸乐，故无有苦音，一切音声皆是法音、皆是欢喜之声。
琉璃为地，琉璃宝为地，表法身清净、遍一切处。金绳界道，金绳为道路之分界，表修行有轨则、有次第。城阙宫阁轩窗罗网皆七宝成，城阙所以防卫、宫阁所以居止、轩窗所以通明、罗网所以庄严，皆以七宝所成，表七觉支、七圣财、七科道品，一一皆以无漏功德所成。
名相虽多，皆可会归自心，若执著名相以为实有，则同于数他宝，自无半分钱，当知一切名相，皆是指示自心之符号，会得自心，则一切名相皆得解脱。名相纷纷不是真，会得自心万法亲，琉璃国土非他物，便是当人一念仁。
名相既明，当进而探究义理之深奥。此段经文之义理，可从四个层面而深入：一者愿与土之关系，二者净与秽之对照，三者依与正之圆融，四者事与理之无碍。先明愿与土之关系。
药师如来因地行菩萨道时，发十二微妙上愿，由愿力故，感得东方净琉璃世界之功德庄严，是故愿为因、土为果，愿为能感、土为所感，无愿则无土，有愿必有土，因果相应，丝毫不爽。
此义犹如世人发愿，若发愿做善人，则感得善缘、善报；若发愿做恶人，则感得恶缘、恶报。菩萨发大愿，历劫修行，则感得清净佛土，此是因果之必然。然此非是心外有土，乃是愿力净心之所感现，所谓心净则国土净，正是此义。
药师如来因地以清净愿心、清净行愿，历劫熏修，故果地感得清净佛土，一切依正庄严，皆是愿心之流现、皆是行愿之果报。是故修学药师法门者，当知净土非从外得，乃是自心愿行之所成就，若能如药师如来发大愿、行菩萨道，则当下即是净土、当下即是琉璃世界，不必远求东方、不必等待命终。
次明净与秽之对照。世尊说彼佛土一向清净，即是对此娑婆世界一向杂染而说。娑婆世界，众生业力所感，土地瓦砾、荆棘丛生，女人多障、恶趣充满，苦音遍闻、烦恼炽盛，与彼净土形成鲜明对照。
然此净秽之差别，非是佛土有定实之净秽，乃是众生业力之所感现。同一世界，业清净者见为净土，业杂染者见为秽土，犹如饿鬼见水为脓血、天人见水为琉璃、人见水为水、鱼见水为居所，业力不同，所见各异。是故娑婆与净琉璃，本非二物，只因众生业力有净有秽，故见有不同。
修学者若能自净其心、自净其业，则娑婆即是净琉璃、释迦即是药师，不必舍此求彼、不必离秽求净。然此非是拨无净土，而是了达净秽唯心，于事中仍须发愿往生、仍须修行净业，事理不二，方是中道。三者明依与正之圆融。依报者，国土世界、山河大地、宫殿园林，是为依报；正报者，佛菩萨身相、功德、智慧，是为正报。依报由正报所感，正报由依报所养，依正不二，圆融无碍。
药师如来之正报，身如琉璃、内外明彻，故依报之土亦以琉璃为地；药师如来之正报，光明遍照、无有障碍，故依报之宫阁轩窗亦皆通明、无有壅塞；药师如来之正报，七宝功德之所成就，故依报之城阙罗网亦皆七宝所成。
正报有何等功德，依报即有何等庄严，依正圆融，不可分割。此义推而广之，一切众生之正报与依报，亦复如是，有清净之心，则感清净之土；有杂染之心，则感杂染之土，心土不二，依正圆融。
是故修学者当知，欲净其土，先净其心；欲净其境，先净其身，身心清净，则国土自然清净。四者明事与理之无碍。事者，净土种种庄严之事相，琉璃为地、金绳界道、七宝宫阁，历历可见；理者，一切法自性本空、本来清净、本来光明，无一法可得。事不碍理，理不碍事，事即是理，理即是事，圆融无碍。
琉璃为地，事也；琉璃体性本空，即是理。七宝宫阁，事也；七宝唯是一心所现，即是理。若执事迷理，则落于有相；若执理废事，则落于顽空。唯有理事圆融，方是药师法门之真义。药师如来以清净愿心，现种种庄严之事，虽现事相而不著事相，虽不著相而恒现事相，正是理事无碍之法界。
修学者当于事中见理、于理中见事，不废一法、不执一法，方与药师如来之愿力相应。四义既明，则知此段经文，非是徒说净土庄严，乃是指示修行之要诀：发愿为因、净心为本、依正圆融、理事无碍。若能依此修行，则现身即是药师、当下即是净土，何待远求。
义理幽深不易穷，愿土净秽本相通，依正圆融无二致，事理无碍法界中。
义理既明，当进而论观行之方法。此段经文，非但可以解义，亦可以作观行，若能依经作观，则功德无量、利益无边。观行之法，略说有五：一者名号观，二者净土观，三者依报观，四者正报观，五者唯心观。
先明名号观。修行者于静坐之时，先调身、调息、调心，身正、息匀、心静，然后至心称念“南无药师琉璃光如来”名号，或一字一字念、或一句一句念，或金刚持、或出声念，随力所宜，要在念念分明、字字清楚，不令昏沉、不令掉举。
念时当观，药师如来之名号，即是药师如来之法身，名号之外无别佛，佛之外无别名号，名号与佛，不二不异。我今称念名号，即是以我之心，感佛之心，以我之口，诵佛之号，身口意三业，皆与药师如来相应。如是念念相续，不令间断，则自然业障消除、善根增长，现世安乐、命终净土。
此名号观，最为简易、最为稳当，三根普被、利钝全收，末世众生尤宜修学。二者明净土观。修行者于静坐之时，观想东方去此过十恒河沙等佛土，有世界名净琉璃，佛号药师琉璃光如来，今现在说法。
彼佛土一向清净，无有女人、无有恶趣、无有苦音，纯是菩萨、纯是善法。作此观时，当令此净土境界历历在目，如在目前，不令模糊、不令散失。观彼土清净，当思自心本来清净，只因无明覆蔽，故见为秽土，今以佛力加持、以观行力，渐渐破除无明，则自心之净土自然显现。观彼土无有女人，当思自心无有烦恼、无有爱执，女人之相本来是空。
观彼土无有恶趣，当思自心无有恶业、无有恶念，三恶道本来不生。如是观察，则净土与自心，非一非异，虽在娑婆，已常在净琉璃世界之中。三者明依报观。
修行者于静坐之时，广观彼佛土依报庄严：琉璃为地，黄金为绳，界分道路，平直无碍；城阙高广，七宝所成，光明照耀；宫阁层层，无有穷尽，每一宫阁皆有宝座、宝具；轩窗玲珑，七宝合成，光明交映；罗网弥覆，宝铃宝珠，微风吹动，出微妙音，说种种法。如是一一观察，令其明了，如眼所见。
观琉璃为地，当观自心地清净、内外明彻；观金绳界道，当观自心修行有轨则、不偏不倚；观城阙七宝，当观自心七觉支圆满；观宫阁层层，当观自心功德层层增进；观轩窗通明，当观自心智慧光明、无有障碍；观罗网法音，当观自心六根对尘皆说妙法。
如是依报之观，一一会归自心，则非但见彼佛土之庄严，亦见自心之庄严。四者明正报观。修行者于静坐之时，观药师琉璃光如来，身如琉璃，内外明彻，净无瑕秽，光明遍照，无有障碍。佛身光明，遍照十方一切世界，照见一切众生，令其离苦得乐。佛坐宝座，说微妙法，无量菩萨围绕恭敬。
作此观时，当观药师如来之身，即是我之法身，我之本性与药师如来，本来不二，只因迷故，见有自他，今以观行力，渐渐觉悟，则自他不二、生佛一如。观佛身琉璃，当观自身本来清净、本来光明；观佛光明遍照，当观自心智慧光明遍照一切；观佛说法，当观自心本来具有无量法门。如是正报观，能令修行者速与佛相应、速得佛加持。
五者明唯心观。修行者于静坐之时，观一切净土庄严、一切佛菩萨、一切功德，皆不离自心，皆是自心之所变现。心外无佛、心外无法、心外无净土，所谓“应观法界性，一切唯心造”。
作此观时，当离一切相、离一切执，虽观净土而不著净土相，虽观佛身而不著佛身相，虽称名号而不著名号相，能所双忘、心佛一如，则当下即是药师如来、当下即是净琉璃世界。
此唯心观，最为究竟、最为第一，能令修行者速证无生法忍。五观虽有次第，然可圆修，或专修一观、或兼修数观，随力所宜，要在持之以恒、不令间断。若能日日修习、年年不辍，则自然业障消除、善根增长，现世得安乐、命终生净土，决定不虚妄。
观行分明在目前，琉璃国土不离禅，若能会得唯心旨，何须东去觅金仙。
观行既明，当进而论证入之阶位。此段经文，从凡夫发心到成佛证果，含摄无量阶位，若能依经修行，则可历历升进，终至佛地。证入之阶，略说有五：一者信位，二者解位，三者行位，四者证位，五者佛位。
先明信位。凡夫闻此经文，闻药师如来之名号、闻净琉璃世界之功德，心生欢喜、生信心、发愿往生，此即入于信位。信位之中，虽未能深解义理、未能精进修行，然以信心故，已种善根、已结佛缘，终不堕落、终得解脱。
经中说，闻药师名号，暂生恭敬，尚得无量功德，何况至心信受、发愿往生。信为道源功德母，一切善法皆由信生，是故修行之初，首当立信。二者明解位。既已立信，当进而求解，读诵经典、亲近善知识、思维义理，于药师如来之愿行、于净琉璃世界之功德，渐能通达、渐能明了，知一切法皆是自心所现、知净秽唯是业力所感，此即入于解位。
解位之中，虽未能如说修行，然以解力故，不生邪见、不入歧途，能正信佛法、能分辨正邪。解目行足，以解导行，则修行不迷。三者明行位。既已得解，当依解起行，持名、诵经、礼拜、忏悔、布施、持戒、忍辱、精进，种种善行，一一修习，于日常生活之中，处处与药师愿力相应、处处与净土功德相应，此即入于行位。
行位之中，虽未能证得真理，然以行力故，业障渐消、善根渐长，烦恼渐薄、智慧渐明，步步升进、不退转。行如人足，能至宝所，故修行当以行为要。四者明证位。既已修行，功行圆满，则能证入真理，断烦恼、证菩提，得无生法忍、得陀罗尼，能分身十方、能度化众生，此即入于证位。证位有浅深，从初住到等觉，皆是证位，随其功行浅深，证有高下。
然证位之中，虽已证真理，尚未圆满，仍须进修，直至佛地。五者明佛位。功行圆满、断证究竟，则成佛道，号药师琉璃光如来，坐净琉璃世界，度化一切众生，此即佛位。佛位之中，愿力圆满、功德圆满、净土圆满，一切无量、一切无边，如经所说，我若一劫若一劫余说不能尽。
五位虽有次第，然可圆融，信中有解、解中有行、行中有证，非是截然分别。末世众生根器钝劣，虽不能一时顿证佛位，然当从信位入手，渐次升进，只要不退转、不间断，终究必至佛地。经中说药师如来行菩萨道时所发大愿，正是从信位到佛位之全部历程，菩萨历劫修行，不辞劳苦，终成佛道，即是后学人之榜样。
证入阶位历历明，从凡至佛不需惊，只要愿心不退转，步步莲花步步生。
经文义理、观行、证入既已广明，当复引诸祖师之开示，以为证明、以为指南。天台智者大师，为天台宗之祖，于《摩诃止观》中广明净土之义，谓净土有四：凡圣同居土、方便有余土、实报无障碍土、常寂光土。
药师琉璃光如来之净土，四土圆融，凡圣同居土中无有女人恶趣，纯是菩萨；方便有余土中无有声闻缘觉，纯是菩萨；实报无障碍土中依正圆融、理事无碍；常寂光土中寂而常照、照而常寂。
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